Als Chromatin (griech. chroma Farbe) bezeichnet man ein mit basischen Kernfarbstoffen anfärbbares und lichtmikroskopisch sichtbares Fadengerüst im Zellkern einer eukaryontischen Zelle. Es besteht aus DNA und Histonen, die zusammen die Nucleosomen aufbauen, sowie aus Nichthiston-Proteinen. Während der Mitose und Meiose wandelt sich das fädige Material des Chromatins in kompaktere Strukturen, die Chromosomen, um.
Das Verständnis der Chromatinstruktur und ihres Beitrags zu Regulation der Gene ist Inhalt der Epigenetik.